3. Associomics of membrane proteins in two model organisms, yeast and arabidopsis (ASSOCIOPORT)

Förderkennzeichen: QLG2-CT-2001-01297

Das EU-Projekt Associoport stellte sich zur Aufgabe, ein „large scale“ Verfahren zur systematischen Identifikation von Protein-Protein Interaktionen mit der spezifischen Ausrichtung auf Membranproteine auf Basis des Split-Ubiquitin Systems zu etablieren. Als Modellorganismen dienten Saccharomyces cerevisiae und Arabidopsis thaliana.

Projektpartner:

Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP)
Eberhard-Karls-Universität Tübingen

Lab. De Physiologie Cellulaire
Université libre de Bruxelles

Institut für Mikrobiologie
Heinrich-Heine Universität Düsseldorf

Departamento Microbiol. y Genetica
Universidad de Salamanca

Unité de Bioinformatique
Université libre de Bruxelles

Sympore GmbH, Tübingen

GenExpress GmbH, Berlin

GenExpress als Industriepartner zeichnete sich verantwortlich für die Bereitstellung geeigneter PCR-Rodukte zur in vivo Rekombination dieser Fragmente in das Split Ubiquitin System (SUS). Sowie die Etablierung eines DNA-Chips für das Hefe/Arabidopsis Protein-Expressions-Monitoring.

Für die Generierung der PCR-Produkte etablierte GenExpress ein standardisiertes Verfahren zur optimalen Amplifikation aller relevanten Gene aus Arabidopsis und Hefe. Hierfür wurden Kluster ausgewählt die sich an der Länge der Fragmente orientierten (300bp-1000bp, 1000bp-3000bp und >3000bp). Die Variierung der PCR-Parameter ermöglichte die Hochdurchsatz-Amplikfikation von 419 Arabidopsis und 281 Hefe Genen im quantitativen Maßstab.

Im weiteren Verlauf stand die Frage im Raum, ob eine Anpassung des SUS über die Gateway-Technologie möglich ist. In diesem Zusammenhang wurden Genexpressionsvektoren auf Basis des Gateway-Systems entwickelt.

News

24.08.2018

Sie finden eine aktualisierte Beschreibung unserer Leistungen und Preisbeispiele.

02.08.2018

Positivkontrollen für die PCR: Einen Ausschnitt unseres Produkt-Portfolios finden Sie nun in der

Beispielliste (169 KB)

20.07.2018

Unsere Datenschutzerklärung wurde nach der neuen EU-Datenschutz Grundverordnung (EU-DSGVO) aktualisiert >>>

11.01.2018

Die neuen Zertifikate

ISO 9001-2015 stehen hier für Sie zum Download bereit.

09.01.2018

GenExpress hat im November 2017 die Restrukturierung des QMS mit dem Zertifizierungsaudit gemäß ISO 9001:2015 erfolgreich bestanden.

2017

Restrukturierung des QMS von ISO 9001-2008 auf ISO 9001-2015

18.06.2017

GenExpress feiert sein 20jähriges Jubiläum mit einem Hoffest in der historischen Malzfabrik Berlin

22.06.2012

Abschluss Verbundprojekt BIGRUDI.

Mehr Informationen >>>

18.03.2011

GenExpress präsentiert die englische Version der Internetseite

06.01.2011

GenExpress hat im Dezember 2010 das Re-Zertifizierungsaudit gemäß ISO 9001:2008 erfolgreich bestanden.

Die neuen Zertifikate  stehen zum Download bereit.

02.07.2010

GenExpress präsentiert sich mit neuer Internetseite

30.04.2010

Erfolgreicher Abschluß des EU geförderten USDEP Projektes. Mehr Information >>>